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¿Qué es un valor pA (2)?

¿Qué es un valor pA (2)?


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Vi este artículo http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16710314 y mencionaba valores pA (2) y no tenía idea de cuáles eran. ¿Qué son? ¿Qué quieren decir?

Si es posible, sería genial si pudiera citar algunos artículos de revistas / libros / otras fuentes confiables para que yo los indague.


Investigando un poco, encontré algunos recursos:

Diseño y modelos para estimar la potencia antagonista (pA2, Kd e IC50) tras la detección del antagonismo observado en presencia de actividad intrínseca.

y FARMACODINÁMICA en la página 30, describe pA2 como:

indica afinidad del antagonista por los receptores

(como acaba de comentar Alan Boyd)


A continuación se muestran las respuestas generadas usando la preparación aislada de íleon de cobaya para determinar un valor de pA2 para una muestra del antagonista colinérgico homatropina. Las respuestas se expresan en milímetros +/- SDM (n = 4). Grafique los datos y luego determine mediante análisis de Schild el valor de pA2 y la pendiente de Schild. ¿Qué conclusiones puedes sacar? ¿El experimento / los datos cumplen los criterios para un análisis de Schild válido?

Acetilcolina ACH sola ACH + Homotropina ACH + Homotropina ACH + Concentración de homotrop 3x10 ^ -9 M 1x10 ^ 8M 3x10 ^ -8M [Molar]

3 x 10 ^ -9 3 +/- 1
6 x 10 ^ -9 8 +/- 3 Sin respuesta 3 x 10 ^ -8 28 +/- 6 10 +/- 4 Sin respuesta 6 x 10 ^ -8 38 +/- 8 21 +/- 9 5 + / -2 Sin respuesta 3 x 10 ^ -7 55 +/- 5 43 +/- 7 27 +/- 9 10 +/- 4 6 x 10 ^ -7 56 +/- 5 52 +/- 3 38 +/- 7 20 +/- 7 3 x 10 ^ -6 - 55 +/- 4 53 +/- 6 43 +/- 6 6 x 10 ^ -6 - - 56 +/- 2 54 +/- 5


¿Qué es un valor pA (2)? - biología

A = 4,00 puntos de calificación
A- = 3.70 puntos de calificación
B + = 3.33 puntos de calificación
B = 3.00 puntos de calificación
B- = 2.70 puntos de calificación
C + = 2.30 puntos de calificación
C = 2.00 puntos de calificación
C- = 1,70 puntos de calificación
D + = 1,30 puntos de calificación
D = 1.00 puntos de calificación
D- = 0,70 puntos de calificación

Los cursos P / NP (Aprobado / No Aprobado) no se tienen en cuenta en el GPA del estudiante
I (incompletos) y W (retiros) no recibo puntos de calificación y no tienen un efecto en el GPA

Para obtener el GPA del estudiante de ejemplo, el total de puntos de calificación se divide por el total de horas de crédito intentadas.

Puntos de calificación totales

GPA actual y acumulativo

Puedes totalizar tu cursos y créditos del semestre actual con nuestra Calculadora de GPA en línea (arriba).

Para calcular su G.P.A. acumulativo, puede utilizar esta herramienta en línea. Si prefiere calcular el promedio de calificaciones total a mano, totalice las horas de crédito y luego los puntos de calificación de todos los semestres. Divida el total de puntos de calificación por el total de horas de crédito.

Para calcular cursos AP o de Honores: Al tomar AP (colocación avanzada) o cursos de honores, los puntos de calificación generalmente se ponderan. Por ejemplo, se agrega medio punto (.50) para los cursos de honores, y se agrega un punto completo (1.0) para los cursos AP (A entonces equivale a 4.50 para una clase de Honores, o 5.00 para una clase de Colocación Avanzada). Como las escuelas pueden diferir al asignar el valor en puntos, comuníquese con su universidad para conocer su sistema de calificación).


The GRE and PA School: The Pre-PA Advisor Series

The Pre-PA Advisor Series Bienvenido a la PA Advisors Series & # 8211, una serie especial de publicaciones donde los solicitantes de escuelas de PA como usted hacen las preguntas difíciles y los directores de admisiones de las mejores escuelas de PA brindan las respuestas. Esta publicación también se incluye como la parte cinco de nuestra serie de cinco partes & # 8220The 5 steps to PA school. & # 8221 Today We [& hellip]


1. Solicitantes elegibles

Instituciones de educación superior

  • Instituciones de educación superior públicas o controladas por el estado
  • Instituciones privadas de educación superior

Siempre se alienta a los siguientes tipos de instituciones de educación superior a solicitar el apoyo de los NIH como instituciones públicas o privadas de educación superior:

  • Instituciones que sirven a los hispanos
  • Colegios y universidades históricamente negros (HBCU)
  • Colegios y universidades controlados por tribus (TCCU)
  • Instituciones de servicio para nativos de Alaska y nativos de Hawái
  • Instituciones al servicio de los nativos americanos asiáticos americanos de las islas del Pacífico (AANAPISI)

Organizaciones sin fines de lucro distintas de las instituciones de educación superior

  • Organizaciones sin fines de lucro con estatus 501 (c) (3) del IRS (que no sean instituciones de educación superior)
  • Organizaciones sin fines de lucro sin estado 501 (c) (3) del IRS (que no sean instituciones de educación superior)
  • Gobiernos estatales
  • Gobiernos del condado
  • Gobiernos de ciudades o municipios
  • Gobiernos de distritos especiales
  • Gobiernos tribales indios / nativos americanos (reconocidos a nivel federal)
  • Gobiernos tribales indios / nativos americanos (distintos de los reconocidos federalmente)
  • Territorio o posesión de EE. UU.
  • Distritos escolares independientes
  • Autoridades de Vivienda Pública / Autoridades de Vivienda Indígenas
  • Organizaciones tribales nativas americanas (que no sean gobiernos tribales reconocidos a nivel federal)
  • Organizaciones religiosas o comunitarias
  • Organizaciones regionales

Organizaciones solicitantes

Las organizaciones solicitantes deben completar y mantener los siguientes registros como se describe en la Guía de solicitud SF 424 (R&R) para ser elegibles para solicitar o recibir un premio. Todos los registros deben completarse antes de enviar la solicitud. El registro puede demorar 6 semanas o más, por lo que los solicitantes deben comenzar el proceso de registro lo antes posible. La Política de los NIH sobre la presentación tardía de solicitudes de subvención establece que no completar los registros antes de la fecha de vencimiento no es una razón válida para una presentación tardía.

    - Todos los registros requieren que los solicitantes reciban un número DUNS. Después de obtener un número DUNS, los solicitantes pueden comenzar a registrarse tanto en SAM como en eRA Commons. Se debe utilizar el mismo número DUNS para todos los registros, así como en la solicitud de subvención. (anteriormente CCR): los solicitantes deben completar y mantener un registro activo, que requiere renovación al menos una vez al año. El proceso de renovación puede requerir tanto tiempo como el registro inicial. El registro SAM incluye la asignación de un Código de Entidad Comercial y Gubernamental (CAGE) para organizaciones nacionales a las que aún no se les ha asignado un Código CAGE.
      - Las organizaciones extranjeras deben obtener un código NCAGE (en lugar de un código CAGE) para poder registrarse en SAM.

    Directores de programa / Investigadores principales (PD (s) / IP (s))

    Todos los PD (s) / PI (s) deben tener una cuenta eRA Commons. Los PD (s) / PI (s) deben trabajar con los funcionarios de su organización para crear una nueva cuenta o para afiliar su cuenta existente con la organización solicitante en eRA Commons. Si el PD / PI también es el oficial de firma de la organización, debe tener dos cuentas de eRA Commons distintas, una para cada función. Obtener una cuenta de eRA Commons puede demorar hasta 2 semanas.

    Para las instituciones / organizaciones que proponen múltiples PD / IP, visite la Política de Director de Programa Múltiple / Investigador Principal y los detalles de envío en el Componente Perfil de Persona Principal / Clave (Ampliado) de la Guía de Aplicación SF424 (R&R).

    Actualmente es director de proyecto / investigador principal (PD / PI) o PD / IP múltiple en al menos una subvención de investigación activa de varios años del NHLBI que proporciona un apoyo sustancial (definido como al menos $ 200k de costos directos por año). Los premios relacionados con los recursos (p. Ej., R24, U24, U2C, P2C), premios de conferencias (p. Ej., R13, U13) o premios de educación en investigación (p. Ej., R25, UE5) no cumplir con este criterio.

    2. Costos compartidos

    3. Información adicional sobre elegibilidad

    El NIH no aceptará solicitudes duplicadas o muy superpuestas bajo revisión al mismo tiempo. Esto significa que los NIH no aceptarán:

    • Una nueva solicitud (A0) que se envía antes de la emisión de la declaración resumida de la revisión de una solicitud nueva (A0) o reenvío (A1) superpuesta.
    • Una solicitud de reenvío (A1) que se envía antes de la emisión de la declaración resumida de la revisión de la nueva solicitud (A0) anterior.
    • Una solicitud que se superpone sustancialmente con otra solicitud pendiente de apelación de la revisión inicial por pares (consulte NOT-OD-11-101)

    Una talla no sirve para todos

    La escuela de biología que elijas para invertir tu tiempo y dinero en los asuntos. Para ayudarlo a tomar la decisión adecuada para usted, hemos desarrollado una serie de clasificaciones específicas importantes, incluida esta lista de las mejores escuelas de biología.

    Para ayudarlo aún más a tomar la decisión universitaria, hemos desarrollado una herramienta única llamada College Combat que le permite comparar escuelas en función de los factores que más le importan. Cuando tenga algo de tiempo, compruébelo; es posible que desee marcar el enlace como favorito para no olvidarlo.


    Fundamentos de ingeniería de la biotecnología

    2.28.2.4 Esfuerzo cortante en reactores

    El esfuerzo cortante es otro tema particularmente sensible en los cultivos de células de mamíferos. Muchos tipos de células responden al esfuerzo cortante. Por ejemplo, se encontró que la tensión de cizallamiento afectaba la proliferación de células endoteliales y que se orientaban en la dirección del flujo (referencia 35 en referencia 31). Está ampliamente aceptado que el esfuerzo cortante tiene un impacto determinante sobre la función y la viabilidad de los tejidos. Se informan diferentes valores para el esfuerzo cortante máximo sostenible de diferentes tipos de células. Para las suspensiones de células, los experimentos con viscosímetros han demostrado que para una amplia variedad de líneas celulares de mamíferos, las cizallas de 1 dyn cm -2 dañaban las células, las cizallas de 0,1 dyn cm -2 eran ideales y las cizallas de 0,01 dyn cm -2 eran insuficiente para promover el crecimiento (referencia 38 en la referencia 31). Se deben realizar más estudios sobre el estrés para presentar una visión más amplia de los efectos moleculares de la cizalladura en diferentes tipos de células. Si están bien diseñados, los biorreactores pueden servir para este propósito. Los umbrales precisos de esfuerzo cortante aún no se han informado en la literatura para guiar el diseño de sistemas de reactores.


    ¿Qué es un valor pA (2)? - biología

    Institutos Nacionales de Salud (NIH)

    Instituto Nacional sobre el Envejecimiento (NIA)
    Instituto Nacional de Salud de las Minorías y Disparidades en la Salud (NIMHD)

    Investigación en biología del envejecimiento para abordar las disparidades en la salud (Admin Supp)

    Se pueden otorgar fondos adicionales como suplementos a los premios para padres utilizando los siguientes códigos de actividad:

    Las solicitudes de suplementos administrativos deben presentarse en papel para los siguientes códigos de actividad:

    Las solicitudes de suplementos administrativos pueden enviarse electrónicamente para los siguientes códigos de actividad:

    Premio al investigador clínico K08 (CIA)
    Premio al desarrollo profesional de investigación orientada al paciente y mentor de K23
    Beca para proyectos de investigación R01
    Proyectos de educación R25

      - Aviso de participación en PA-17-164. Consulte el Aviso NOT-MD-17-002. -Aviso de cambio en los códigos de actividades elegibles para PA-17-164. Consulte el Aviso NOT-AG-17-006.

    Este Anuncio de Oportunidad de Financiamiento (FOA) anuncia la disponibilidad de suplementos administrativos para apoyar la investigación de la biología del envejecimiento que aborda las disparidades en la salud.

    3 de mayo de 2017, a las 5:00 p.m., hora local de la organización solicitante.

    Se anima a los solicitantes a que presenten su solicitud con anticipación para tener el tiempo suficiente para hacer las correcciones a los errores encontrados en la solicitud durante el proceso de presentación antes de la fecha de vencimiento.

    Es fundamental que los solicitantes sigan las instrucciones de la Guía de aplicación (SF424 (R&R) Application Guide, Guía del usuario del Suplemento administrativo de eRA Commons o PHS 398 Application Guide, según corresponda) excepto cuando se indique lo contrario (en este FOA o en un Aviso del Guía de los NIH para subvenciones y contratos). Se requiere el cumplimiento de todos los requisitos (tanto en la Guía de aplicación como en el FOA) y se hace cumplir estrictamente. Los solicitantes deben leer y seguir todas las instrucciones de solicitud en la Guía de solicitud, así como las instrucciones específicas del programa que se indican en la Sección IV. Cuando las instrucciones específicas del programa se desvíen de las de la Guía de aplicación, siga las instrucciones específicas del programa. Las solicitudes que no cumplan con estas instrucciones pueden retrasarse o no aceptarse para su revisión.

    Este programa de Suplemento Administrativo para el año fiscal 2017 se ofrece para respaldar la investigación que aborda las disparidades en el envejecimiento y la salud, con un enfoque específico en los procesos y mecanismos biológicos que son relevantes para las disparidades de salud en el envejecimiento.

    Las disparidades en salud son diferencias en la incidencia, prevalencia y carga de enfermedades y diferencias en la esperanza de vida, tasas de mortalidad y causas de muerte que existen entre los grupos de población en los Estados Unidos. Las disparidades en la salud están asociadas con una gama amplia, compleja e interrelacionada de factores que influyen en la salud, aceleran el envejecimiento y reducen la esperanza de vida. La exposición a factores estresantes únicos, el estrés crónico duradero, las desventajas socioeconómicas y otras formas de adversidad ambiental se han postulado como determinantes importantes de las disparidades en la salud en los Estados Unidos.

    Una dirección de investigación actual es el examen de los mecanismos biológicos, como la función y la comunicación celular, los indicadores fisiológicos y la estabilidad genética, que pueden vincularse con factores ambientales para explicar el envejecimiento acelerado entre poblaciones específicas que experimentan disparidades en la salud.

    Los objetivos de la investigación sobre disparidades en la salud de la NIA son (1) comprender los factores ambientales y los mecanismos biológicos relacionados que disminuyen la salud y reducen la esperanza de vida de las poblaciones que experimentan disparidades en la salud, (2) desarrollar estrategias para aumentar la esperanza de vida y la esperanza de vida entre los adultos mayores y mejorar el estado de salud de los adultos mayores de poblaciones desatendidas y desfavorecidas, y (3) utilizar los conocimientos y los avances de la investigación para informar las políticas que abordan y reducen las disparidades en la salud.

    La NIA está interesada en la investigación de la biología del envejecimiento para explorar los mecanismos a través de los cuales los factores ambientales crean y mantienen las disparidades de salud relacionadas con el envejecimiento. Por ejemplo, el estrés crónico vinculado a vivir en condiciones ambientales adversas para ciertos grupos de posición racial / étnica o socioeconómica puede influir en los procesos biológicos clave del envejecimiento, como la estabilidad genética y la proteostasis. La acumulación de daños en el ADN a lo largo de la vida puede ser importante para el envejecimiento biológico. Una pregunta importante es si este daño genético puede acelerarse frente al estrés crónico. La rápida atrición de las regiones de los telómeros se ha utilizado como marcador de estabilidad genética, proporcionando un indicador del desarrollo prematuro de enfermedades como la anemia aplásica.

    Otros procesos biológicos pueden estar relacionados con las duras condiciones ambientales y, por lo tanto, son relevantes para la investigación de las disparidades en la salud relacionadas con el envejecimiento. La investigación ha demostrado que cuando un individuo percibe el estrés, el hipotálamo del cerebro emite una alerta a las glándulas suprarrenales, lo que indica una necesidad fisiológica de responder a una amenaza potencialmente dañina del eje hipotálamo-pituitario-adrenal (HPA). Las glándulas suprarrenales producen cortisol que repone las reservas de energía que se han agotado por la adrenalina inicial. El HPA determina en última instancia si el estrés será manejado por una respuesta fisiológica o por una sobrecarga de HPA. La sobrecarga crónica de HPA, que puede ser causada por las percepciones crónicas y rutinarias del estrés de un individuo en condiciones ambientales adversas, se ha relacionado con resultados de salud deficientes, como diabetes mellitus, depresión, asma y síndrome de fatiga crónica.

    Específicamente, para este Anuncio de oportunidad de financiamiento (FOA) estamos interesados ​​en proyectos que exploran procesos, incluida la función y la comunicación celular, los indicadores fisiológicos y la estabilidad genética, que permiten que las condiciones ambientales adversas se incrusten biológicamente.

    Los temas / estudios apropiados incluyen:

    • Estudios sobre interacciones edad x gen x ambiente donde el genotipo (variante alélica) o las condiciones ambientales (por ejemplo, exposición relativa a peligros a menudo más común en vecindarios desfavorecidos) se recapitulan en organismos de laboratorio.
    • Los estudios se centraron en identificar las diferencias moleculares que contribuyen a las disparidades raciales, étnicas o de género en las respuestas al estrés, incluidas las diferencias en las vías del estrés como la detección de nutrientes, hormonas, inflamación, inmuno-senescencia, metabolómica o genética / epigenética.
    • Los estudios se centraron en las diferencias en los metabolomas que pueden estar vinculados a disparidades raciales o étnicas en los resultados funcionales, fisiológicos o metabólicos a lo largo de la vida y en la vejez.
    • Investigación que examinará los mecanismos biológicos que subyacen a las disparidades de salud en la disminución de la función relacionada con el envejecimiento en los sistemas de órganos (por ejemplo, hígado, pulmón, corazón, riñones).

    La intención de este FOA cubre, pero no se limita a, los siguientes tipos de aplicaciones:

    Aplicaciones que proponen sumar estudios con células o tejidos humanos a los estudios básicos en curso sobre envejecimiento para realizar análisis exploratorios y comparativos.

    El instrumento de financiación será el mismo que el premio principal.

    Donación: Un mecanismo de apoyo que proporciona dinero, propiedad o ambos a una entidad elegible para llevar a cabo un proyecto o actividad aprobados.

    Suplementos administrativos no competidores

    El número de premios depende de las asignaciones de los NIH y de la presentación de un número suficiente de solicitudes meritorias.

    NIA tiene la intención de comprometer $ 250,000 en el año fiscal 2017 para financiar 4 premios.

    Las solicitudes de presupuesto no pueden ser de más de $ 45,500 en costos directos.

    El mecanismo de financiación que se utiliza para respaldar este programa, los suplementos administrativos, se puede utilizar para cubrir los aumentos de costos asociados con el logro de ciertos nuevos objetivos de investigación, siempre que los objetivos de investigación estén dentro del alcance original del proyecto revisado y aprobado por pares, o los aumentos de costos son por gastos imprevistos dentro del alcance original del proyecto. Cualquier aumento de costos debe resultar de la realización de modificaciones al proyecto que aumentarían o preservarían el impacto general del proyecto de acuerdo con sus objetivos y propósitos originalmente aprobados.

    Los períodos del proyecto y del presupuesto deben estar dentro del período del proyecto actualmente aprobado para la concesión principal existente. Todos los premios son por un período de un año.

    Las políticas de subvenciones de los NIH como se describen en la Declaración de la política de subvenciones de los NIH se aplicará a las solicitudes enviadas y premios otorgados en respuesta a este FOA.

    Todas las organizaciones que administran un premio para padres elegible pueden solicitar un suplemento en virtud de este anuncio.

    Instituciones de educación superior

    • Instituciones de educación superior públicas o controladas por el estado
    • Instituciones privadas de educación superior

    Siempre se alienta a los siguientes tipos de instituciones de educación superior a solicitar el apoyo de los NIH como instituciones públicas o privadas de educación superior:

    • Instituciones que sirven a los hispanos
    • Colegios y universidades históricamente negros (HBCU)
    • Colegios y universidades controlados por tribus (TCCU)
    • Instituciones de servicio para nativos de Alaska y nativos de Hawái
    • Instituciones al servicio de los nativos americanos de origen asiático de las islas del Pacífico (AANAPISI)

    Organizaciones sin fines de lucro distintas de las instituciones de educación superior

    • Organizaciones sin fines de lucro con estatus 501 (c) (3) del IRS (que no sean instituciones de educación superior)
    • Organizaciones sin fines de lucro sin estado 501 (c) (3) del IRS (que no sean instituciones de educación superior)
    • Gobiernos estatales
    • Gobiernos del condado
    • Gobiernos de ciudades o municipios
    • Gobiernos de distritos especiales
    • Gobiernos tribales indios / nativos americanos (reconocidos a nivel federal)
    • Gobiernos tribales indios / nativos americanos (distintos de los reconocidos federalmente)
    • Agencias elegibles del gobierno federal
    • Territorio o posesión de EE. UU.
    • Distritos escolares independientes
    • Autoridades de Vivienda Pública / Autoridades de Vivienda Indígenas
    • Organizaciones tribales nativas americanas (que no sean gobiernos tribales reconocidos a nivel federal)
    • Organizaciones religiosas o comunitarias
    • Organizaciones regionales

    Este anuncio es para complementar los proyectos existentes. Para ser elegible, el premio principal debe estar activo y la investigación propuesta en el suplemento debe realizarse dentro del segmento competitivo. El complemento propuesto debe tener por objeto prever un aumento de los costos debido a circunstancias imprevistas. Todos los costos adicionales deben estar dentro del alcance del proyecto revisado y aprobado por pares.

    IMPORTANTE: La investigación propuesta por el concesionario de los NIH en la solicitud del suplemento debe estar dentro del alcance original del proyecto de subvención respaldado por los NIH.

    Entidades no nacionales (no estadounidenses) (instituciones extranjeras) no son elegible para postularse.
    Componentes no nacionales (no estadounidenses) de organizaciones estadounidenses no son elegible para postularse.
    Componentes extraños, como definido en la Declaración de política de subvenciones de los NIH, no son permitido.

    Organizaciones solicitantes

    Las organizaciones solicitantes deben completar y mantener los siguientes registros como se describe en la Guía de solicitud SF 424 (R&R) para ser elegibles para solicitar o recibir un premio. Dado que los suplementos administrativos se realizan en contra de las subvenciones activas y los acuerdos de cooperación, es posible que muchos de estos registros ya estén vigentes. Todos los registros deben completarse antes de enviar la solicitud. El registro puede demorar 6 semanas o más, por lo que los solicitantes deben comenzar el proceso de registro lo antes posible. La Política de los NIH sobre la presentación tardía de solicitudes de subvención establece que no completar los registros antes de la fecha de vencimiento no es una razón válida para una presentación tardía.

    • Sistema de numeración universal de Dun and Bradstreet (DUNS): todos los registros requieren que los solicitantes reciban un número DUNS. Después de obtener un número DUNS, los solicitantes pueden comenzar a registrarse tanto en SAM como en eRA Commons. Se debe usar el mismo número DUNS para todos los registros, así como en la solicitud de subvención.
    • Sistema de Gestión de Premios (SAM) (anteriormente CCR): los solicitantes deben completar y mantener un registro activo, que requiere renovación al menos una vez al año. El proceso de renovación puede requerir tanto tiempo como el registro inicial. El registro SAM incluye la asignación de un Código de Entidad Comercial y Gubernamental (CAGE) para las organizaciones nacionales a las que aún no se les ha asignado un Código CAGE.
    • Código de Entidad Comercial y Gubernamental de la OTAN (NCAGE): las organizaciones extranjeras deben obtener un código NCAGE (en lugar de un código CAGE) para registrarse en SAM.
    • eRA Commons: los solicitantes deben tener un número DUNS activo y un registro SAM para completar el registro eRA Commons. Las organizaciones pueden registrarse en eRA Commons mientras trabajan a través de su registro SAM o Grants.gov. eRA Commons requiere que las organizaciones identifiquen al menos un Oficial firmante (SO) y al menos una cuenta de Director de programa / Investigador principal (PD / PI) para poder enviar una solicitud.
    • Grants.gov: los solicitantes deben tener un número DUNS activo y un registro SAM para poder completar el registro en Grants.gov. El registro en Grants.gov solo es necesario si planea enviar mediante la opción 'Envío de solicitud electrónica a través de Grants.gov'.

    Directores de programa / Investigadores principales (PD (s) / IP (s))

    Todos los PD (s) / PI (s) deben tener una cuenta eRA Commons. Los PD / IP deben trabajar con los funcionarios de su organización para crear una nueva cuenta o para afiliar su cuenta existente con la organización solicitante en eRA Commons. Si el PD / IP también es el Oficial de firma de la organización, debe tener dos cuentas distintas de eRA Commons, una para cada función. Obtener una cuenta de eRA Commons puede demorar hasta 2 semanas.

    Las personas deben tener una subvención activa o un acuerdo de cooperación, y la investigación propuesta en el suplemento debe realizarse dentro del segmento competitivo de la subvención activa. Se anima a las personas a trabajar con sus organizaciones para desarrollar aplicaciones de apoyo.

    Para los suplementos a los premios para padres que incluyen múltiples PD / IP, el suplemento puede ser solicitado por cualquiera o todos los PD / IP (de acuerdo con el plan de liderazgo existente) y presentado por la institución adjudicataria del premio para padres. No utilice esta solicitud de suplemento administrativo para agregar, eliminar o cambiar los PD / PI enumerados en la concesión de los padres. Visite la Política de director de programas múltiples / investigador principal en la Guía de solicitud de SF424 (R&R) para obtener más información.

    Este FOA no requiere costos compartidos como se define en el Declaración de la política de subvenciones de los NIH.

    Solo se puede enviar una solicitud por premio para padres de NIA.

    Las organizaciones solicitantes pueden presentar más de una solicitud, siempre que cada una sea lo suficientemente distinta de cualquier otro suplemento administrativo que esté considerando actualmente el Instituto o Centro NIH adjudicatario.

    Solo se considerarán los premios NIA activos con al menos 18 meses restantes en el momento de la presentación. Los premios en períodos de extensión sin costo no pueden enviar una solicitud en respuesta a este FOA.

    Los solicitantes deben preparar las solicitudes utilizando los formularios actuales de acuerdo con la Guía de solicitud.

    Los botones para acceder al sistema ASSIST en línea o para descargar formularios de solicitud están disponibles en la Parte 1 de este FOA. Consulte con su oficina administrativa para obtener instrucciones si planea utilizar una solución institucional de sistema a sistema.

    Todos los formularios deben completarse para las actividades complementarias. solamente y no debe reflejar fondos o actividades para el premio a los padres otorgado previamente.

    Es fundamental que los solicitantes sigan las instrucciones para su opción de envío (Guía de solicitud SF424 (R&R), Guía del usuario del Suplemento administrativo de eRA Commons o la Guía de solicitud de PHS 398, según corresponda), incluidas las Instrucciones de solicitud de subvención suplementarias, salvo que se indique lo contrario en este anuncio de oportunidad de financiación. Se requiere el cumplimiento de los requisitos documentados y se hace cumplir estrictamente. Las solicitudes que no cumplan con estas instrucciones pueden retrasarse o no aceptarse para su revisión.

    Deben seguirse todas las limitaciones de página aplicables a la concesión para padres como se describe en la Guía de solicitud y la Tabla de límites de página, con las siguientes excepciones o requisitos adicionales:

    La sección de Estrategia de investigación de la solicitud de suplemento administrativo no puede exceder las 5 páginas.

    Las solicitudes de suplementos administrativos para la mayoría de los códigos de actividad de un solo proyecto se pueden enviar mediante procesos de presentación en papel o electrónicos. Las solicitudes de suplementos administrativos para códigos de actividad de proyectos múltiples deben enviarse mediante el proceso de presentación en papel. Consulte la sección Código de actividad en la Parte 1 para determinar si el envío electrónico es una opción para su código de actividad.

    Los solicitantes que presenten solicitudes en papel deben usar los Formularios de solicitud de PHS 398 y la Guía de solicitud de PHS 398.

    Instrucciones para el envío de solicitudes electrónicas a través de Grants.gov

    Utilice los botones "Aplicar" en la Parte I de este anuncio para acceder al paquete de formularios de solicitud publicado en Grants.gov. Si se presenta con más de un paquete de formularios, utilice el ID de la competencia y los Títulos de la competencia proporcionados para determinar el paquete de formularios de solicitud más apropiado para su situación.

    Prepare aplicaciones utilizando los formularios SF424 (R&R) asociados con el paquete elegido. Tenga en cuenta que algunos formularios marcados como opcionales en el paquete de solicitud son necesarios para el envío de solicitudes para este anuncio. Siga todas las instrucciones de la Guía de aplicación SF424 (R&R) para asegurarse de completar todos los formularios necesarios y opcionales correspondientes, con la siguiente orientación adicional:

    • Formulario de cobertura de R&R: seleccione "Revisión" en el campo "Tipo de aplicación".
    • Formulario del plan de investigación: como mínimo, la sección de Estrategia de investigación debe completarse y debe incluir un resumen o resumen del premio o proyecto principal financiado. También deben incluirse otras secciones si las actividades complementarias propuestas las modifican.
    • Formulario de ubicación del sitio del proyecto / desempeño: incluya el sitio principal donde se realizarán las actividades complementarias propuestas. Si una parte de las actividades complementarias propuestas se llevará a cabo en cualquier otro sitio, identifique las ubicaciones en los campos provistos.
    • Formulario Sr / Key Personnel: Incluya al PD / IP como la primera persona (independientemente de su rol en las actividades complementarias). Enumere cualquier otro personal senior / clave que se agregue a través de este suplemento, o para quien se soliciten fondos adicionales a través de este suplemento, incluya un bosquejo biográfico de cada uno.
    • Formularios de presupuesto (por ejemplo, Presupuesto de R&R, Presupuesto de capacitación de PHS 398): Incluya solo los fondos solicitados para las actividades complementarias adicionales.
    • Formulario de información adicional del proyecto de R&R: si corresponde, adjunte documentos PDF en el campo "Otros adjuntos" que indiquen que la experiencia de investigación propuesta fue aprobada por el Comité Institucional de Cuidado y Uso de Animales (IACUC) o la Junta de Revisión Institucional (IRB) de sujetos humanos en el concesionario institución. Denomine los documentos “IACUC Documentation.pdf” y / o “IRB Documentation.pdf”. También se debe garantizar el cumplimiento de la política de los NIH para incluir mujeres y minorías en los estudios clínicos, si se planea la participación de sujetos humanos adicionales para el suplemento.

    Instrucciones especiales para presentaciones simplificadas utilizando eRA Commons para presentaciones electrónicas

    NIH ofrece un sistema simplificado a través de eRA Commons para presentar suplementos administrativos. Inicie sesión en eRA Commons, identifique la concesión de los padres y prepare una solicitud de suplemento administrativo. Está disponible una Guía del usuario para enviar a través de este sistema, con la siguiente orientación adicional:

    • Se debe ingresar la información presupuestaria de la institución beneficiaria en las pestañas provistas para cada período presupuestario seleccionado.
    • Dado que no hay una plantilla o formulario disponible para la información del presupuesto de la sub-subvención, toda la información de la sub-subvención debe incluirse como un archivo PDF adjunto en la sección Presupuestos del sub-beneficiario que muestre los fondos solicitados (por período presupuestario) y utilizando las mismas categorías proporcionadas para la institución beneficiaria. El archivo adjunto también debe incluir cualquier información relacionada con la justificación del presupuesto.
    • Utilice la función "Agregar otros archivos adjuntos" para incluir los siguientes documentos PDF:
    • Estrategia de investigación que incluye un resumen o resumen del proyecto o premio financiado por los padres.
    • Si corresponde, adjunte documentos que indiquen que la experiencia de investigación propuesta fue aprobada por el Comité Institucional de Uso y Cuidado de Animales (IACUC) o la Junta de Revisión Institucional de sujetos humanos (IRB) en la institución beneficiaria. También se debe garantizar el cumplimiento de la política de los NIH para incluir mujeres y minorías en los estudios clínicos, si se planea la participación de sujetos humanos adicionales para el componente del suplemento.

    Instrucciones para envíos en papel utilizando los formularios de solicitud de PHS 398

    Las solicitudes deben prepararse utilizando los formularios de solicitud de subvención de investigación PHS 398 y las instrucciones para preparar una solicitud de subvención de investigación, con la siguiente orientación adicional:

    • Lista de comprobación: seleccione "Revisión" en el campo "Tipo de aplicación".
    • Página frontal (página 1 del formulario): En la página frontal del formulario de solicitud, tenga en cuenta que su solicitud responde a un anuncio de programa específico e ingrese el título y el número de este anuncio.
    • Plan de investigación: como mínimo, la sección de Estrategia de investigación debe completarse y debe incluir un resumen o resumen del premio o proyecto principal financiado. También deben incluirse otras secciones si las actividades complementarias propuestas las modifican.
    • Sección de Proyectos / Sitios de Desempeño (Formulario Página 2): Incluya el sitio principal donde se realizarán las actividades complementarias propuestas. Si una parte de las actividades complementarias propuestas se llevará a cabo en cualquier otro sitio, identifique las ubicaciones en los campos provistos.
    • Sección Sr / Key Personnel (Formulario Página 2): Incluya al PD / IP como la primera persona (independientemente de su rol en las actividades complementarias). Enumere cualquier otro personal senior / clave que se agregue a través de este suplemento, o para quien se soliciten fondos adicionales a través de este suplemento, incluya un bosquejo biográfico de cada uno.
    • Budget for Entire Proposed Project Period (Form Page 5): A proposed budget should be submitted using the PHS 398 budget forms and should only include funds requested for the additional supplement activities.
    • If applicable, attach documentation in the Appendix section indicating that the proposed research experience was approved by the Institutional Animal Care and Use Committee (IACUC) or human subjects Institutional Review Board (IRB) at the grantee institution. Adherence to the NIH policy for including women and minorities in clinical studies must also be ensured, if additional human subjects’ involvement is planned for the supplement component.

    The grantee institution, on behalf of the PD/PI of the parent award, must submit the request for supplemental funds directly to the awarding component that supports the parent award. Submit a signed, typewritten original of the application, including the checklist, to:

    Carl V. Hill, Ph.D., M.P.H.
    National Institute on Aging
    Director, Office of Special Populations
    31 Center Drive, MSC-2292
    Bethesda, MD 20892
    Email: [email protected]

    See Part 1. Section III.1 for information regarding the requirement for obtaining a unique entity identifier and for completing and maintaining active registrations in System for Award Management (SAM), NATO Commercial and Government Entity (NCAGE) Code (if applicable), eRA Commons, and Grants.gov.

    Part I. Overview Information contains information about Key Dates and Times. Applicants are encouraged to submit electronic applications before the due date to ensure they have time to make any application corrections that might be necessary for successful submission. When a submission date falls on a weekend or Federal holiday, the application deadline is automatically extended to the next business day.

    Applicants are responsible for viewing their electronic application before the due date in the eRA Commons to ensure accurate and successful submission.

    For electronic application submission, information on the submission process and a definition of on-time submission are provided in the SF424(R&R) Application Guide.

    For paper-based application submission, information on the process of receipt and determining if your application is considered on-time is described in detail in the PHS 398 Application Guide.

    This initiative is not subject to intergovernmental review.

    All NIH awards are subject to the terms and conditions, cost principles, and other considerations described in the NIH Grants Policy Statement.

    Pre-award costs are allowable only as described in the NIH Grants Policy Statement.

    Applications must be submitted using the instructions specified above.

    Applicants must complete all required registrations prior to submission. Sección III. Eligibility Information contains information about registration.

    For assistance with your electronic application or for more information on the electronic submission process, visit Applying Electronically. If you encounter a system issue beyond your control that threatens your ability to complete the submission process on-time, you must follow the Guidelines for Applicants Experiencing System Issues. For assistance with application submission contact the Application Submission Contacts in Section VII.

    Important reminders:
    For applications submitted electronically on the SF424 (R&R) Application forms, all PD(s)/PI(s) must include their eRA Commons ID in the Credential field of the Senior/Key Person Profile form of the SF 424(R&R) Application Package. Failure to register in the Commons and to include a valid PD/PI Commons ID in the credential field will prevent the successful submission of an electronic application to NIH.

    The applicant organization must ensure that the DUNS number it provides on the application is the same number used in the organization’s profile in the eRA Commons and for the (SAM). Additional information may be found in the Application Guide.

    See more tips for avoiding common errors.

    Administrative Supplements do not receive peer review. Instead, the administrative criteria described below will be considered in the administrative evaluation process.

    The staff of the NIH awarding component will evaluate requests for a supplement to determine its overall merit. The following general criteria will be used:

    Budget and Period of Support

    NIH staff will consider whether the budget and the requested period of support are fully justified and reasonable in relation to the proposed research.

    NIH staff will consider the ability of the proposed supplement activities to increase or preserve the parent award’s overall impact within the original scope of award:

    For Research and Research Center Awards Only (P50, R01, R03, R25): Will the administrative supplement increase or preserve the likelihood for the project to exert a sustained, powerful influence on aging biology research that addresses health disparities related to aging?

    For Career Development Awards Only (K23, K08): Will the administrative supplement increase or preserve the likelihood for the candidate to maintain a strong aging research program that addresses health disparities related to aging?

    In addition, each of the following criteria will be evaluated as applicable for the proposed supplement.

    For research that involves human subjects but does not involve one of the six categories of research that are exempt under 45 CFR Part 46, NIH staff will evaluate the justification for involvement of human subjects and the proposed protections from research risk relating to their participation according to the following five review criteria: 1) risk to subjects, 2) adequacy of protection against risks, 3) potential benefits to the subjects and others, 4) importance of the knowledge to be gained, and 5) data and safety monitoring for clinical trials.

    For research that involves human subjects and meets the criteria for one or more of the six categories of research that are exempt under 45 CFR Part 46, NIH staff will evaluate: 1) the justification for the exemption, 2) human subjects involvement and characteristics, and 3) sources of materials. For additional information on review of the Human Subjects section, please refer to the Guidelines for the Review of Human Subjects.

    When the proposed project involves human subjects and/or NIH-defined clinical research, the committee will evaluate the proposed plans for the inclusion (or exclusion) of individuals on the basis of sex/gender, race, and ethnicity, as well as the inclusion (or exclusion) of children to determine if it is justified in terms of the scientific goals and research strategy proposed. For additional information on review of the Inclusion section, please refer to the Guidelines for the Review of Inclusion in Clinical Research.

    NIH staff will evaluate the involvement of live vertebrate animals as part of the scientific assessment according to the following five points: (1) description of proposed procedures involving animals, including species, strains, ages, sex, and total number to be used (2) justifications for the use of animals versus alternative models and for the appropriateness of the species proposed (3) interventions to minimize discomfort, distress, pain and injury and (4) justification for euthanasia method if NOT consistent with the AVMA Guidelines for the Euthanasia of Animals. Reviewers will assess the use of chimpanzees as they would any other application proposing the use of vertebrate animals. For additional information on review of the Vertebrate Animals section, please refer to the Worksheet for Review of the Vertebrate Animal Section.

    NIH staff will assess whether materials or procedures proposed are potentially hazardous to research personnel and/or the environment, and if needed, determine whether adequate protection is proposed.

    Administrative supplement requests will undergo an administrative evaluation by NIH staff, but not a full peer review. Applications submitted for this funding opportunity will be assigned to the awarding component for the parent award and will be administratively evaluated using the criteria shown above.

    A formal notification in the form of a Notice of Award (NoA) will be provided to the applicant organization for successful applications. This may be as an NoA for the supplemental activities only alternatively, it may be as either a revision to the current year NoA or included as part of a future year NoA. The NoA signed by the grants management officer is the authorizing document and will be sent via email to the grantee’s business official.

    Awardees must comply with any funding restrictions described in Section IV.5. Funding Restrictions. Selection of an application for award is not an authorization to begin performance. Any costs incurred before receipt of the NoA are at the recipient's risk. These costs may be reimbursed only to the extent considered allowable pre-award costs.

    Any application awarded in response to this FOA will be subject to terms and conditions found on the Award Conditions and Information for NIH Grants website. This includes any recent legislation and policy applicable to awards that is highlighted on this website. When calculating the award for additional funds, NIH will 1) prorate funding if the requested budget period is adjusted at the time of award, and 2) use the institution’s current F&A rate i.e., the rate in effect when the new funding is provided.

    Recipients of federal financial assistance (FFA) from HHS must administer their programs in compliance with federal civil rights law. This means that recipients of HHS funds must ensure equal access to their programs without regard to a person’s race, color, national origin, disability, age and, in some circumstances, sex and religion. This includes ensuring your programs are accessible to persons with limited English proficiency. HHS recognizes that research projects are often limited in scope for many reasons that are nondiscriminatory, such as the principal investigator’s scientific interest, funding limitations, recruitment requirements, and other considerations. Thus, criteria in research protocols that target or exclude certain populations are warranted where nondiscriminatory justifications establish that such criteria are appropriate with respect to the health or safety of the subjects, the scientific study design, or the purpose of the research.

    For additional guidance regarding how the provisions apply to NIH grant programs, please contact the Scientific/Research Contact that is identified in Section VII under Agency Contacts of this FOA. HHS provides general guidance to recipients of FFA on meeting their legal obligation to take reasonable steps to provide meaningful access to their programs by persons with limited English proficiency. Please see http://www.hhs.gov/ocr/civilrights/resources/laws/revisedlep.html. The HHS Office for Civil Rights also provides guidance on complying with civil rights laws enforced by HHS. Please see http://www.hhs.gov/ocr/civilrights/understanding/section1557/index.html and http://www.hhs.gov/ocr/civilrights/understanding/index.html. Recipients of FFA also have specific legal obligations for serving qualified individuals with disabilities. Please see http://www.hhs.gov/ocr/civilrights/understanding/disability/index.html. Please contact the HHS Office for Civil Rights for more information about obligations and prohibitions under federal civil rights laws at http://www.hhs.gov/ocr/office/about/rgn-hqaddresses.html or call 1-800-368-1019 or TDD 1-800-537-7697. Also note it is an HHS Departmental goal to ensure access to quality, culturally competent care, including long-term services and supports, for vulnerable populations. For further guidance on providing culturally and linguistically appropriate services, recipients should review the National Standards for Culturally and Linguistically Appropriate Services in Health and Health Care at http://minorityhealth.hhs.gov/omh/browse.aspx?lvl=2&lvlid=53.

    In accordance with the statutory provisions contained in Section 872 of the Duncan Hunter National Defense Authorization Act of Fiscal Year 2009 (Public Law 110-417), NIH awards will be subject to the Federal Awardee Performance and Integrity Information System (FAPIIS) requirements. FAPIIS requires Federal award making officials to review and consider information about an applicant in the designated integrity and performance system (currently FAPIIS) prior to making an award. An applicant, at its option, may review information in the designated integrity and performance systems accessible through FAPIIS and comment on any information about itself that a Federal agency previously entered and is currently in FAPIIS. The Federal awarding agency will consider any comments by the applicant, in addition to other information in FAPIIS, in making a judgement about the applicant’s integrity, business ethics, and record of performance under Federal awards when completing the review of risk posed by applicants as described in 45 CFR Part 75.205 “Federal awarding agency review of risk posed by applicants.” This provision will apply to all NIH grants and cooperative agreements except fellowships.

    Cooperative Agreement Terms and Conditions of Award

    Any supplements to Cooperative Agreements will be subject to the same Cooperative Agreement terms and conditions as the parent award.

    Reporting requirements will be specified in the terms and conditions of award as applicable to the supplemental activities. In most non-competing continuation applications, the progress report and budget for the supplement must be included with, but clearly delineated from, the progress report and budget for the parent award. The progress report must include information about the activities supported by the supplement even if support for future years is not requested. Continuation of support for the supplement activities in the remaining years of the competitive segment of the grant will depend upon satisfactory review by the NIH awarding component of progress for both the parent award and the supplement project, the research proposed for the next budget period, and the appropriateness of the proposed budget for the proposed effort. This information is submitted with the Research Performance Progress Report (RPPR) and financial statements as required in the NIH Grants Policy Statement.

    The Federal Funding Accountability and Transparency Act of 2006 (Transparency Act), includes a requirement for awardees of Federal grants to report information about first-tier subawards and executive compensation under Federal assistance awards issued in FY2011 or later. All awardees of applicable NIH grants and cooperative agreements are required to report to the Federal Subaward Reporting System (FSRS) available at www.fsrs.gov on all subawards over $25,000. Ver el NIH Grants Policy Statement for additional information on this reporting requirement.

    In accordance with the regulatory requirements provided at 45 CFR 75.113 and Appendix XII to 45 CFR Part 75, recipients that have currently active Federal grants, cooperative agreements, and procurement contracts from all Federal awarding agencies with a cumulative total value greater than $10,000,000 for any period of time during the period of performance of a Federal award, must report and maintain the currency of information reported in the System for Award Management (SAM) about civil, criminal, and administrative proceedings in connection with the award or performance of a Federal award that reached final disposition within the most recent five-year period. The recipient must also make semiannual disclosures regarding such proceedings. Proceedings information will be made publicly available in the designated integrity and performance system (currently FAPIIS). This is a statutory requirement under section 872 of Public Law 110-417, as amended (41 U.S.C. 2313). As required by section 3010 of Public Law 111-212, all information posted in the designated integrity and performance system on or after April 15, 2011, except past performance reviews required for Federal procurement contracts, will be publicly available. Full reporting requirements and procedures are found in Appendix XII to 45 CFR Part 75 – Award Term and Conditions for Recipient Integrity and Performance Matters.

    We encourage inquiries concerning this funding opportunity and welcome the opportunity to answer questions from potential applicants.

    eRA Service Desk (Questions regarding ASSIST, eRA Commons registration, submitting and tracking an application, documenting system problems that threaten submission by the due date, post submission issues)
    Finding Help Online: http://grants.nih.gov/support/ (preferred method of contact)
    Telephone: 301-402-7469 or 866-504-9552 (Toll Free)

    Grants.gov Customer Support (Questions regarding Grants.gov registration and submission, downloading forms and application packages)
    Contact Center Telephone: 800-518-4726
    Email: [email protected]

    GrantsInfo (Questions regarding application instructions and process, finding NIH grant resources)
    Email: [email protected] (preferred method of contact)
    Telephone: 301-710-0267

    Felipe Sierra, Ph.D.
    National Institute on Aging (NIA)
    Telephone: 301-496-6402
    Email: [email protected]

    Ron Kohanski, Ph.D.
    National Institute on Aging (NIA)
    Telephone: 301-496-6402
    Email: [email protected]

    Lesa McQueen, M.Sc.
    National Institute on Aging (NIA)
    Telephone: 301-496-1472
    Email: [email protected]

    Recently issued trans-NIH policy notices may affect your application submission. A full list of policy notices published by NIH is provided in the NIH Guide for Grants and Contracts. All awards are subject to the terms and conditions, cost principles, and other considerations described in the NIH Grants Policy Statement.

    Awards are made under the authorization of Sections 301 and 405 of the Public Health Service Act as amended (42 USC 241 and 284) and under Federal Regulations 42 CFR Part 52 and 45 CFR Part 75.


    Getting Licensed as a Physician Assistant

    No matter where you live in the United States, you will be required to complete specific licensing to become a physician assistant. All states and the District of Columbia will have their own licensing system, so the specifics may vary, but you will be required to complete this step regardless of location. Therefore, after graduation, you will need to complete the licensing requirements to become legally eligible to work.

    All candidates for physician assistant careers will need to complete the Physician Assistant National Certifying Examination, also called PANCE, which is administered by the National Commission on Certification of Physician Assistants (NCCPA). When you pass this exam, you can legally use the designation Physician Assistant-Certified, or “PA-C” for short.

    To even be eligible for the exam, you will have to graduate from an accredited school. To take the test, you will have to submit an application and a $500 payment in advance. You may schedule the exam anytime within the 180 days after payment.

    The examination will involve many different topics related to the profession. The test takes five hours to complete and includes 300 multiple-choice questions that are given in five blocks of 60 questions. You will also have an allotment of 45 minutes total for breaks during your testing.

    You will have six years after completing schooling to pass the exam. During these six years, you may take the test up to six times if needed. If you take the test six times and fail, or if the six years after graduation is completed, you will be ineligible to take the test again. If this happens, you will have to complete an unabridged program all over again to become eligible. In other words, study hard, focus during your studies, and learn as much as possible so you pass the test quickly.

    In addition to the examination for licensing, state law requires you hold an agreement with a supervising physician. This agreement will include required collaboration between the assistant and the physician, although the doctor does not need to be working on site with the assistant at all times.

    Throughout your career, you will need to continually educate yourself on the latest techniques and information about the physician assistant profession. This is a good idea in all careers, but in the career of a physician assistant, it is actually required. To maintain certification, you must complete 100 hours of continuing education every two years, and you must re-certify every ten years.


    Fondo

    The transcriptional architecture is a complex and dynamic aspect of a cell's function. Next generation sequencing of steady state RNA (RNA-seq) gives unprecedented detail about the RNA landscape within a cell. Not only can expression levels of genes be interrogated without specific prior knowledge, but comparisons of expression levels between genes within a sample can be made. It has also been demonstrated that splicing variants [1, 2] and single nucleotide polymorphisms [3] can be detected through sequencing the transcriptome, opening up the opportunity to interrogate allele-specific expression and RNA editing.

    An important aspect of dealing with the vast amounts of data generated from short read sequencing is the processing methods used to extract and interpret the information. Experience with microarray data has repeatedly shown that normalization is a critical component of the processing pipeline, allowing accurate estimation and detection of differential expression (DE) [4]. The aim of normalization is to remove systematic technical effects that occur in the data to ensure that technical bias has minimal impact on the results. However, the procedure for generating RNA-seq data is fundamentally different from that for microarray data, so the normalization methods used are not directly applicable. It has been suggested that 'One particularly powerful advantage of RNA-seq is that it can capture transcriptome dynamics across different tissues or conditions without sophisticated normalization of data sets' [5]. We demonstrate here that the reality of RNA-seq data analysis is not this simple normalization is often still an important consideration.

    Current RNA-seq analysis methods typically standardize data between samples by scaling the number of reads in a given lane or library to a common value across all sequenced libraries in the experiment. For example, several authors have modeled the observed counts for a gene with a mean that includes a factor for the total number of reads [6–8]. These approaches can differ in the distributional assumptions made for inferring differences, but the consensus is to use the total number of reads in the model. Similarly, for LONG-SAGE-seq data, 't Hoen et al. [9] use the square root of scaled counts or the beta-binomial model of Vencio et al. [10], both of which use the total number of observed tags. For normalization, Mortazavi et al. [11] adjust their counts to reads per kilobase per million mapped (RPKM), suggesting it 'facilitates transparent comparison of transcript levels both within and between samples.' By contrast, Cloonan et al. [12] log-transform the gene length-normalized count data and apply standard microarray analysis techniques (quantile normalization and moderated t-statistics). Sultan et al. [2] normalize read counts by the 'virtual length' of the gene, the number of unique 27-mers in exonic sequence, as well as by the total number of reads. Recently, Balwierz et al. [13] illustrated that deepCAGE (deep sequencing cap analysis of gene expression) data follow an approximate power law distribution and proposed a normalization strategy that equates the read count distributions across samples.

    Scaling to library size as a form of normalization makes intuitive sense, given it is expected that sequencing a sample to half the depth will give, on average, half the number of reads mapping to each gene. We believe this is appropriate for normalizing between replicate samples of an RNA population. However, library size scaling is too simple for many biological applications. The number of tags expected to map to a gene is not only dependent on the expression level and length of the gene, but also the composition of the RNA population that is being sampled. Thus, if a large number of genes are unique to, or highly expressed in, one experimental condition, the sequencing 'real estate' available for the remaining genes in that sample is decreased. If not adjusted for, this sampling artifact can force the DE analysis to be skewed towards one experimental condition. Current analysis methods [6, 11] have not accounted for this proportionality property of the data explicitly, potentially giving rise to higher false positive rates and lower power to detect true differences.

    The fundamental issue here is the appropriate metric of expression to compare across samples. The standard procedure is to compute the proportion of each gene's reads relative to the total number of reads and compare that across all samples, either by transforming the original data or by introducing a constant into a statistical model. However, since different experimental conditions (for example, tissues) express diverse RNA repertoires, we cannot always expect the proportions to be directly comparable. Furthermore, we argue that in the discovery of biologically meaningful changes in expression, it should be considered undesirable to have under- or oversampling effects (discussed further below) guiding the DE calls. The normalization method presented below uses the raw data to estimate appropriate scaling factors that can be used in downstream statistical analysis procedures, thus accounting for the sampling properties of RNA-seq data.


    Is it the most important number?

    los R number is one of the big three.

    Otro es severity - some people have a very mild disease that does not cause many problems. But coronavirus and the disease it causes, Covid-19, can be severe and deadly.

    The last is the number of cases, which is important for deciding when to act. If you have a high number, but ease restrictions so the reproduction number is about one, then you will continue to have a high number of cases.